El LED no está roto. Funciona perfectamente y se ilumina en todos los colores, pero no le da la gana de activarse con las notificaciones.
Cuando seleccionas los diferentes colores dentre de Settings ->Notifications light se enciende un momentín para indicar el color. A modo de muestra.
Y sí, obviamente al cargar también se enciende.
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He mirado por los foros de MIUI y al parecer no es un problema sólo mío. Gente que actualiza vía OTa y el LED le deja de funcionar, gente a la que el LEd se le pone en plan atracción de feria y no para de parpadear en todos los colores...
Lo que me han recomendado es que baje una app específica para el las notificaciones LED del google play.