ya partición si no la has borrado está hecha, pero si ya activaste el app2sd estará llena de los programas que ya tenías instalados y puede que algunos te funcionen y otros no, por lo que recomiendo que sería bueno que formateases esa partición o hicieses un wipe total del móvil si sufres de problemas con las aplicaciones o ves que no arranca.
salu2