Yo lo he hecho arrancando en modo recovery (con el recovery de clockworkmod), puesto que con RootExplorar no puedo hacerlo (no tengo S-OFF hecho). Conecto la desire en modo recovery al ordenador y hago:
adb shell
mount /system
cd /system/app
ls (para ver todas las aplicaciones)
rm "nombre_aplicacion"
Para mover aplicaciones instaladas y dejarlas como aplicacion del sistema (por ejemplo el simchecker)
mount /system
mount /data
mv /data/app/"nombre_aplicacion" /system/app/"nombre_aplicacion"
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