Busca un tutorial que había por aquí sobre cómo flashear con apanda 1.6+ cmlmod 1.4.
Si no recuerdo mal, tenía una primera parte en la que hay que flashear unos archivos mediante linea de comandos, que es donde hay que introducir eso que dices. Tal vez te sirva para adaptarlo a tu caso.
Suerte
EDITO: Aquí está:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=128235
En el apartado "Instalar el Firmware CMLMod 1.4" es donde usan esos comandos. Adáptalos a tu caso.