eso es normal, con todas las roms cuando llevan el a2sd son más lentas que si solo usa la memoria del teléfono, no es lo mismo la velocidad r/w de la memoria interna del teléfono que la de la sd, mientras mejor sea la tarjeta nivel 10, nivel 8, menos se notará eso que con la normal que es de nivel 2.
De todas formas eso es un poco relativo, cuando instalas mucho en la memoria del teléfono y le queda poco libre "le cuesta mover" todo lo que tiene al tener poco espacio, con el a2sd cuando hay muchas aplicaciones va igual prácticamente que cuando tienes pocas (siempre que no agotes también el espacio de la partición ext).
Saludos.