Yo tuve un problema parecido con tanto cambio de ROM, pero no podria decirte con cuales es con la que pasa, eso si cambiando de ROM te dejara de pasar seguro, otro problema posible es que tengas algun Task kill automatico que mate los procesos y mate la ventana de parar (si eso es posible claro esta). De todas formas, hazte un nand backup y elige otra ROM y pontela y ya veras como se soluciona, la RCMix por ejemplo va muy bien y consume poca bateria, ademas yo con el despertador no tengo problemas.
Un saludo.