Con que copies todos los .apk y te hagas un archivo flasheable en update.zip te debería servir sin problemas en Nexus. Ahora faltan los demás archivos que no sean .apk que ya no se ni cuales son.
O si prefieres hacerlo manual que vosotros podéis escribir en /system, te copias todas las apks traducidas y se las pegas en /system/apps.
