Algo estas haciendo mal...
Lo del error.... estas instalando las stocks haciendo format reset? por que si no ya veo yo el lio de aplicaciones de kitkat a JB, lo raro serķa que funcionara todo bien...
Lo del error, tienes instalado swiftkey?
y en cuanto a lo del root, mirate algun video del compi coper190 que estan bien explicados, igual se te pasa algo...depuracion usb.... no se