No el metodo para "ACTUALIZAR" siempre es wipe cache partition y wipe dalvik cache, esto respeta lo que tengas instalado , no lo elimina. En caso de querer eliminar seria Wipe factory reset pero esto te lo borraria todo, y ahora no es lo que queremos, por lo tanto sigue instalando el pack que utilices y si hay apps que quieres prescindir las elimines a traves de titanium. Tambien decirte que cada dos o tres actualizaciones como mucho es recomendable hacer instalacion limpia.
