Se pierde root pero no sube el knox, por eso para no perder root al subir se hace con mobile odin pro 4 que permite hacerlo manteniendo root y contador knox tal cual...
Todas estas dudas se aclaran en el primer post y varios post posteriores al del tutorial, por cosas como estas y evitar errores en el proceso recomiendo leer las veces que sea necesario el tutorial antes de hacerlo...
Un saludo.
P.D.. aun sigo sin mi S4 y sin noticias del Sat..