por eso lo pregunto, porque no aprecio tardanza en arrancar, más o menos como siempre, y en ese caso pienso que mejor dejarlo así y me olvido de hacer zipalign de vez en cuando.
Se ha flasheado bien porque están los archivos, el de dentro de init.d y el otro.

P.D. por si fuera algo a tener en cuenta te comento que estoy con la oficial 4.4.2 odexed.