Acabo de instalar la aplicación que me comentas del Google play, y tras activar el init.d, he reiniciado e instalado el script nuevamente. He reiniciado y dejado unos minutos para que se estabilice. Después he reiniciado e instalado el disable zipalign.
He reiniciado el móvil, he ido system y allí no hay rastro del init.d, tampoco en la raíz del dispositivo, pero el programa puso que estaba "enabled" cuando lo pulsé.
Lo he vuelto a pulsar por si acaso
pero sigue sin aparecer por ningún lado...
La cuestión es que parece que carga más rápido, otro no se si será realidad, o mis ganas de que funcione
Los scripts van de cine desde luego, ningún problema al instalar no nada parecido.