No entiendo bien la pregunta. Quieres borrar los archivos con los que hiciste la actualización y no te aparecen en el explorador de archivos del telefono? Bajate otro explorador de archivos y prueba, o conecta el teléfono a la PC y borralo desde ahí.
Recuerda que hay 2 memorias, la memoria interna ("memorycard0" o "emulated -> "0"; dependiendo del explorador de archivos) y la externa (memorycard1) y que no estes buscando en el almacenamiento equivocado. Suerte!