Yo la borre y al crear un backup me reapareció otra vez. Creo que si la borras también desaparece la otra clockworkmod de /mnt/shell/emulated/blablabla/ la que realmente tiene los backups. Eso es lo que me ocurrió a mi. Luego si la vuelves a crear reaparece otra vez, es como un espejo. Los backups vuelven a aparecer y no se borran, lo puedes comprobar porque el tamaño ocupado de la memoria no cambia.