A ver, es muy facil. En vez de salvar el estado con la opcion del menu de PSX4droid (que es una especie de salvado instantaneo que no cuenta para el juego) lo que tienes que hacer es, una vez pasado el CD1, guardar siguiendo el sistema del juego normal, es decir, menu, save, seleccionar slot, etc. Luego abres la rom del CD2 y cuando te pide cargar al principio, cargas el slot que has salvado antes y sigues jugando normalmente. Es Tan sencillo como eso y funciona 100%, yo lo he hecho asi. El problema que tendreis luego es con la parte del submarino... Pero es cuestion de tiempo que se solucione.
Un saludo!