Algo has hecho mal. Yo siempre recomiendo hacer una instalación limpia en estos casos. Si nunca lo has hecho, flashea la última ROM oficial china por SPFlash Tool que te formatee también la memoria interna del móvil, luego instala el recovery y seguidamente la MIUI de sta-s2z habiendo aplicado previamente todos los wipes correspondientes (data/caché/dalvik) y, en mi caso aunque no lo especifican en el post principal, me gusta también hacer un format system (repito: los wipes y formats antes, nunca después).
Te dejo una captura propia de mi cámara para que veas que sí llega a los 13 megapixels.