Como comentaste martin25es, la app Snapdragon™ BatteryGuru es una porquería, solo hace wakeups inútiles (siempre comprobando tu ubicación para luego que haga lo que le salga del forro de los coj__es, jeje). Lo que si me ha servido ha sido la app de donación de greenify, por el enlace que has puesto recomendado por un hilo del S4, y (de momento) el mod de Intelli3g (un poco lento a la hora de cambiar de 2G a 3G... (es que soy muy exigente)).
Lo que me extraña y mucho, es a la hora de reproducir música, cuando cierro el reproductor, al cabo de x minutos, horas, veo la estadística de la batería y tengo un despertar continuo, como si no hubiera cerrado el reproductor y se encontrara aun reproduciendo la música... no se si puede ser por la micro sd externa (ya que es donde esta alojada la música) o simplemente se queda algún proceso activo del reproductor de música... ¿te has encontrado algún caso parecido?
