Después de ver que con otra rom y otro kernel no me salía la carpeta blobs, descubrí (o al menos, eso parece) que en función del kernel usado, la carpeta blobs incluye partes de diferentes nandroids independientes, es decir, el kernel crea blobs y un montón de subcarpetas para el nandroid1. En el nandroid2 sólo crea subcarpetas con el contenido nuevo.
De todas formas, dicha carpeta se puede borrar sin problemas.