No es recomendable. Ten en cuenta que estás pasando a otra versión de Android. Las Apps que tienes para optimizar batería y rendimiento, no te van a servir en Kitkat, pues trabaja diferente que JB, así que tienes que hacer una instalación limpia. Nada de copiar apks con sus datos ni mucho menos o tendrás problemas. Lo que puedes hacer es copiar sólo las apks sin sus datos, y después restaurar y volver a configurarlas. Eso yo lo he hecho y doy fe de que no da problemas.
Pero eso es todo. Kitkat y JB son versiones que a nivel de funcionamiento son diametralmente opuestas.
Saludos