Acabo de actualizar mi S4 a 4.4.2 siguiendo el tutorial, y todo perfecto, sigo teniendo los contadores a 0 tanto del knox como del contador de flasheos, estado de dispositivo "oficial", rooteado y con la modificación del platform.xml hecha. En mi caso tenia la ultima oficial de orange la 4.3 XXUEMK9. En cuanto al explorador de archivos que he usado, es el ES file explorer.
Gracias compañero por el curro.