bueno a mi también me paso lo mismo que a ti, las app ocultas en la versión 4.3 imposible de ponerlas visibles en la 4.4, ya que en la 4.4 deshabilitar/habilitar no tiene nada que ver. Y al desaparecer la opción de ocultar con ello desapareció también la opción de recuperar las app ocultas.
la solucion, yo fui un poco bruto e hice wipes, y ale solucionado, pero sino también hay otras posibilidades que han comentado en este mismo post:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=791814
Configuraciones > Más > Administrador de Aplicaciones > Inicio de TouchWiz > Borrar Datos. Listo. Las aplicaciones aparecerán de nuevo.