Haz un nandroid de la rom actual, restaurar el backup de la anterior rom y haz backup de los SMS con alguna app del estilo muy backup o titanium backup restaura de nuevo el nandroid de la rom de cyano, instala la misma app con la que as echo el backup de los SMS y restauralos.
Pocas opciones distinta a esta tienes.
Pd: si la anterior ROM no tiene root y te lo pide la app para hacer backup de los SMS tienes un hilo por el foro para ser root con un solo click pones la app que te comentan ya podra funcionar la aplicación de los backup