mmmm... he vuelto a leer la documentación de SetCPU (
http://www.pokedev.com/setcpu), el apartado de Perforlock Disabler, y dice que es un driver de HTC, no un proceso. Tampoco he encontrado el comando asociado al boton perflock disabler. Igual pidiendoselo al desarrollador en el foro de la aplicación lo facilita
http://forum.xda-developers.com/showthread.php?t=505419
Si facilita el comando aosicado al botón de perflock disabler, igual se puede hacer el script que te comentaba.