CWM no es funcional 100% solo sirve para flasear zips y hacer wipes mas que nada, nose si hay alguna ROM que deje flasearse por CWM.
TWRP hay 3 distintos, 2 para JB y 1 para KitKat.
Para JB, uno es para flasear con las stocks que tienen el bootloader desbloqueado y es el mas usado. El otro solo permite flasear zips, y alguna que otra custom para los que llevan de base una stock con el bootloader desbloqueado.
Para CM10.1 hay 2 desarrollos, uno para los que lleven de base las stocks con el bootloader desbloqueado, y otro para los que no, asi que depende de cual tengas de base deberias de usar uno u otro TWRP.
Tambien hay un TWRP para KitKat que como es logico es para KitKat.
Cuando flaseas TWRP se te borrara el de stock, pero en los post de TWRP encontraras una herramienta de instalacion muy util (grandisimo aporte de Reyncla) para flasear tanto la TWRP, como para volver a poner el recover stock.
