Lo de las filas/columnas son funciones del launcher (en CM11 hay 2).
Son las cosas de las versiones nightlies: opciones que desaparecen/aparecen, cosas que funcionaban dejan de funcionar y viceversa, problemas con el rendimiento/consumo de batería, etc.
Lo más seguro es que vuelvan a aparecen en unas cuantas nightlies.
Por supuesto, siempre puedes utilizar otro launcher como Nova, Apex, Yandex...
