Según parece, ya no es necesario el codec x86, así que para que todo esté como debe estar, yo haría lo siguiente: borrar caché y datos y desinstalar el codec x86, luego borrar caché y datos del MX Player; reiniciar la tablet; y finalmente instalar MX Player de nuevo desde Google Play.
De todas formas, antoniopax, ¿solo te pasa reproduciendo mkv o te ocurre también reproduciendo avi? Comprueba si tienes activada la opción de reproducir por h/w+ 10-bit, prueba con esa opción activada y desactivada.