Bueno pues la unica forma de conseguir que no siga contando el tiempo el gps sin tener que reiniciar el telefono es, primero quitar la app endomondo cuando hayamos terminado de usarla y despues desactivar la ubicacion, volverla a activar y volverla a desactivar, asi ya para de contar el tiempo como si estuviese activo el gps ( que realmente no se aun si esta o no activo porque uno no se puede fiar de lo que dicen las estadisticas si realmente hemos desactivado la ubicacion pero por si acaso se hace lo anteriormente dicho y para de contar el tiempo ).
A la espera de alguna solución definitiva, saludos.