Hola monchet, antes que nada agradecer todo tu trabajo, pero quería comentar que después de todas las pruebas que he hecho con todas las ROMS, hasta que no salga una ROM que lo solucione, la solución más fácil (seguramente no la mejor, pero si la más fácil) es la que llevó usando desde el principio.
v03 ya que en la v04 y v05 no funciona, Launcher ápex, mover las apps a la sd con el Force2sd o el link2sd. Programar las apps como el titanium o mybackup o la galería de fotos para que hagan sus copias el la sd externa, no mover las apps que se específica que deben de ir en la memoria interna, como facebook, wattsap, tasker, lucy patcher, y las apps que son widgets como el clima y poco mas.
De ese modo los iconos no de se mueven, las apps no desaparecen y con una sd clase 10 funciona fino, fino.
Hay algun problema que ya he comentado, como apps que no funcionan bien, pero son muy pocas, y en la vO4 y la v05 sucede algo parecido.
Así la memoria interna me utiliza unos 600 mg y queda bastante libre. y todo esta organizado.
Anda bien, y aparte de pequeños detalles es la solución más fácil.
saludos.