En Google lo explicaron hace poco, si quitas una app de esa lista le estas diciendo al sistema que la cierre en cuanto termine con los procesos que tiene abiertos.
Es verdad que no estaría mal un botón en stock pata poder quitarlas de un tirón. Yo lo que hago es cerrarlas según dejo de usarlas, más que nada para que no consuman batería innecesariamente.
Y no, no conozco ningún método pata implementar eso sin cambiar de rom.