no necesariamente, ¿de que equipo estamos hablando?
Te pregunto debido a que yo antes tenia mi Lg optimuz black rooteado y con el asistente de LG lo actualize a la version mas nueva que fue ICS, creo que en tu caso es lo mismo, claro, una vez actualizado por medio del sofware del fabricante te quedaras sin root pero se puede resolver.
si hablamos de que lo quieres actualizar a 4.3 de una ROM cocinada lo unico que hay que hacer es instalarla sobre la que ya tienes y listo.
espero haberte ayudado, si no, aqui estamos.
saludos.