Pufff, creo que lo he solucionado. Se me van a quitar las ganas de flashear por un tiempo. Sus muertos....
Por si os pasa os cuento lo que he hecho.
Antes de probar la ShadowFrost, desde el recovery pasé la partición de la SD de EXT3 a EXT4. No tengo ni pajolera idea de las diferencias pero leí que la ShadowFrost usaba ésta última.
Después de hacer un Repair SD partition el problema de cuelgue se ha solucionado.
Me gustaría saber qué diferencia hay entre EXT3 y EXT4. En fin, ahí os dejo el dato por si a alguien le pasa....