A mi me pasa lo mismo, desde que he actualizado a 4.4.2 dura menos, con la sincronización de Google+, con el Now, con todo, pero con la 4.4 también lo llevaba todo y duraba más.
Con respecto a dejarlo cargando toda la noche, no pasa absolutamente nada, cuando la batería está cargada el cargador deja de suministrar energía y lo podéis comprobar porque se queda frío, mientras que cuando está cargando está caliente.