Si os aparece "Device not found" es porque probablemente no tengáis los drivers instalados. Bajaos el Nexus 5 Multi-tool y os instaláis los drivers. También os servirá por si queréis desbloquear el bootloader o hacer root, entre otras muchas cosas.
Este es el enlace al post de XDA donde está:
http://forum.xda-developers.com/show....php?t=2509428
Seguid los pasos que os va diciendo y listo, son muy sencillitos. Y si no os aclaráis, preguntad.
Saludos