A ver, querría aclarar un poco el tema de las carpetas /system/media y /data/media
Al instalar la rom, efectivamente, en /system, no debe aparecer la carpeta media, como bien ha indicado jrsoft.
El tema es que despues del primer arranque se genera un "acceso directo", a /data/media en /system, es decir, que quedaría como si existiese una carpeta /system/media, pero que realmente apunta a /data/media, esto se puede comprobar, si desde terminal, entrais en /system y haceis un "ls -l" vereis que en la linea de /system/media os aparece una flecha y despues /data/media, si os aparecer asi, todo está como debe.
Para el problema de que no aparece la musica y demas, podeis (a los que os pase) generar un logcat mientras pulsais en la aplicacion DevTools y despues en Media Scanner? nos sería de mucha ayuda para localizar el problema.
Un saludo!
