Lo siento pero el mío es el 821 así que no sé nada de esas apps que quieres desinstalar pero, normalmente, con TitaniumBackup se puede eliminar cualquier app aunque hay que tener especial cuidado con las de sistema, mejor hacer backup de la ROM y antes de desinstalar probar a "congelar" para confirmar que no nos de problemas.
El BusyBox no da ningún problema si no la lías parda :P yo lo tengo instalado porque muchas apps lo requieren pero no lo toco porque no lo controlo, simplemente ahí está

. De todas formas, el tema de los botones LED para notificaciones parece molón a priori pero luego observas que chupa bastante batería y al final acabas desinstalando la app en cuestión. Por cierto, te recomiendo Gravity Box, además de la opción de activar los botones LED para notificaciones tienes otras mil cosas que toquetear