Si ya has instalado con flashtool la rom oficial, la has rooteado después y metido el recovery finamente para instalar otra rom, por ejemplo, ahora entonces es momento de que arranques en recovery apagando el terminal y al encender después, ve pulsando el botón de subir volumen para que cargue el CWM.
Y cierto es lo que dices. De un solo proceso y sin reiniciar, haz todo
