Avances en el tema (por si a alguien con el mismo problema le interesa): La barra de las narices es la Softkeybar, o en cristiano la barra de softkeys. La única manera que he encontrado de hacerla trasparente (esa y la taskbar) es a través del
HDwall, la única pega es que no me apetecía instalar otro gestor de WP, dado que el CHT ya tiene uno bastante completito (tengo instalado el 1.8).
En cuanto a los SoftKeys... parece que el problema viene del propio tema Black. Probablemente Makeveral haya utilizado dicho tema como base para el tema de su rom. Con cualquier otra no ocurre.
Si alguien me puede dirigir a algún tutorial de como crear tu propio tema, se lo agradecería.