Bueno, el primer problema, aunque se ha solucionado. Al abrir el Titanium Backup no me aparecen las copias hechas. Me he quedado helado, asi que he reiniciado, entrado en el recovery, montado la unidad y he volcado la carpeta con las copias del Titanium Backup al PC por si acaso...
Sin embargo, al reiniciar ahora ya el programa si "ve" las copias.
Misterio...