Posiblemente ocurra porque la nandroid compruebe si tienes alguna partición en ext4. Si tú no lo has pasado, a lo mejor la Saurom ya va con ext4 por defecto (no lo se, sinceramente, nunca he llevado esa rom puesta).
Quizás deberías preguntar en el post de la rom si ya va en ext4
Un saludo!