El Super Su hace lo mismo, puedes hacer un Unroot temporal, en cualquier caso, estas mezclando un desarrollo distinto al Root de la Vega de Chainsfire
Lo ideal, para no tener estos problemas (que no lo son) es que uses las Apk del mismo desarrollo y desarrollador, no aplicaciones de un desarrollo que su ultimo update es anterior incluso a la salida al mercado del Note 3 (al caso) y "no compatible" según tu mismo testimonio con este desarrollo
