Cuando trabajas con Sony hay que instalar framework-res.apk y semcgenericuxpres.apk (los dos en la carpeta de framework). También podrías instalar home.apk para evitar ciertos errores.
Los xml están codificados al compilar, por lo que ni los puedes tocar ni los puedes ver.
Para modificar las apk Honami tienes que descargarte el apktool que provee el compañero Rizal Lovins. Está en la sección de ¿apps & themes? del subforo en xda.
Sube capturas de los errores así puedo ayudarte mejor.
Un saludo!