Pues las pelis que me he pasado lo he hecho más o menos como tú:

Resolución: 800x480 (en esta pantalla y con esta resolución es increible ver las pelis)

Bitrate: Fijo o variable (un poco mejor) y entre 850-1100 kbps

FPS: Me quedo en 25. Se ve mejor que bien

Audio: Sumo 3 ó 4 dB también o si puedo, normalizo el audio.

Reproduzco los vídeos con el reproductor original de android o con el yxflash si es un DivX o Xvid, pero puestos a pasar el vídeo, lo paso a MP4/AAC y así no tengo problemas de compatibilidad.

A lo mejor el ligero retraso en audio que notas tenga que ver con el framerate que usas. Si el original estaba a 25 y lo pasas a 30, tiende a desincronizarse un poco conforme avanza el vídeo, y cuanto más largo es, más.

Espero que te ayude y también me gustaría saber qué programa utilizas para pasar el vídeo. Yo uso el format factory, que ya lo usaba con Nokia y no me ha dado nunca problemas.

Saludos!!!