Te comento. Cuando te conectes a youtube desde el navegador, fíjate que no se conecte directamente a la página cuya versión es para dispositivos móviles ->
http://m.youtube.com
Si te conectas como en un ordenador ->
http://www.youtube.com podrás ver que ahí sí te deja seleccionar los vídeos en 1080p FULLHD. Lamentablemente se ven a saltos en la Pipo M9 Pro en streaming a 1080p porque yo he probado la pelicula de AVATAR rippeada de un Blueray a 1080p (6,5GBs) y el reproductor de Video por defecto de Android la reproduce sin problemas.
Generalmente algunas páginas tienen versión móvil y versión ordenador. Una vez estás dentro, suele haber alguna opción por la página que te redirecciona a la página para ordenador.
En cuanto al programa de playstore llamado YOUTUBE, sólo te deja seleccionar entre HD o menos. Parece que FULLHD lo obvia, aunque si funciona igual de mal que lo hace en el navegador, no me extraña.
En HD 720p se ve con una calidad aceptable, pero como nuestra pantalla es FULLHD 1080p siempre vas a notar una falta de nitidez o pixelación.
Espero haberte sido de ayuda.