Sí, una Stock Rom es la que te proporciona el fabricante, en este caso la operadora. Sigue siendo stock aunque la actualizes. Además, añadir que normalmente, a no se que sea una actualización de la rom que ya tienes instalada, SIEMPRE tendras que hacer los wipes, que serian el wipe data, cache, dalvik cache y battery status.
Suerte con el cambio de rom.