Con cualquier explorador de archivos (ej. el Resco Explorer o el mismo explorador del activesync)...
navegas hasta donde tengas el acceso directo a tu programa..
(por ejemplo) \Windows\Menu Inicio\Programas\bestreminder.lnk
y lo copias.
luego vas \Windows\Inicio y pegas el bestreminder.lnk ahi...
ya esta... en cada reinicio se ejecutara el acceso directo al bestreminder.