las aplicaciones que bajais del market estan firmadas y no hay acceso al codigo fuente, podeis ver los graficos etc, pero no el codigo fuente, la extension apk no es mas que un tipo de fichero de compresion, si cambias la extesion apk por zip vereis a lo qu me refiero
Para aplicaciones ya realizadas la conversion no es tan sencilla como cambiar el jar por apk
Peeeero si se trata de una aplicacion que esteis realizando, android es base absoluta de java, la conversion del codigo (no de la aplicacion ya hecha) de java o j2me a android sobre eclipse, no requeriria de una barbaridad de cambios, logicamente teneis que saber manejar el codigo y como se estructura android, pero no seria en extremo complicado si habeis hecho vosotros mismos el codigo java