Comorr? ¿no hay una carpeta llamada "configurations" en archivos de programa? o es que ya has entrado en config.exe y has resaltado la opicion "hide remote tracker" (creo que se llama así)
Si resco no tiene desactivadas las opciones "ocultar archivos ocultos" la carpeta configurations esta´ra vacia (solo hay un tono de alarma) puesto que todos sus archivos estan ocultos
Si lo que pasa es que has ocultado remote tracker usando la opcion que te he comentado Si que es cierto que ha desaparecido la carpeta, no realmente donde la guarda, se que la lleva a otro directorio y supongo que estará totalmente oculta, tendras que buscarla, prueba en \windows o en alguna carpeta nueva del directorio raiz.