¿Te refieres a flashear tu la rom de JB o a esperar la OTA?
Si vas a flashear tu la rom, entonces sí debes hacer wipes de todo para que la instalación se haga limpia. En la sección de roms está todo explicado. Si vas a esperar a que llegue la OTA no hace falta que hagas los wipes; además, como nunca sabes cuando va a llegarte nunca sabrías cuando hacerlo.
Saludos,
MacG.