Los de mensajes,estan en el archivo de MMS.apk,los de contactos y telefono estan dentro del archivo CONTACS,los del correo estan dentro del archivo MMS.apk y los otros estan dentro del archivo APEXLAUNCHER.apk o TOUCHWIZ30LAUNCHER.apk,segun tengas un launcher o el otro.Estan todos dentro de la carpeta system/app.
Todos lo demas archivos se reparten entre el settings.apk,sistemUI.apk.
y en la carpeta de FRAMEWORK tienes 3 mas,el TWFRAMEWORK.apk,FRAMEWORK.apk y lLIDROID-RES.apk.Estos son los principales,con ellos tienes el 90% de la rom tematizada,los dema van todos en sus aplicaciones.Espero haberte ayudado.