Buenas tardes,
la verdad es que lo que dices no tiene mucho sentido... ya que te va a ocupar bastante memoria en la microSD si los dejas ahí... Te recomiendo que hagas una carpeta en el PC y los dejes ahí guardados si queires. Por otro lado tampoco entiendo mucho que quieras guardarlos ya que existen bastantes programas con los que puedes hacer copias de seguridad si te pasa algo para poder restaurarlas después. Te recomiendo el Sprite Backup que puedes encontrar en la zona de descargas.
En cuanto a dónde es mejor dejar los archivos de extensión .cab si es que realmente quieres dejarlos ahí, te recomiendo la microSD puesto que si lo haces en el dispositivo te va a ocupar toda la memoria e iría demasiado lento.
Por otro lado, como bien has dicho, hay programas que sólo se instalan a traves del ordenador y eso es porque la extensión del archivo es .exe con lo que necesitas tener conectada la HTC para poder instalar.
Un saludo y espero haberte ayudado